穿梭齿轮作业：对于水田作业，水田机耕船作业速度一般在4-10Km/h范围内，主要用于旋耕作业。主传动可以固定在某个档位，控制车辆前进和后退。机耕船公司介绍目前的主销式穿梭齿轮有两种布置方式，一种位于方向盘下方，一种位于座椅左侧或右侧；不同之处在于方向盘下方的布置，操作方便，换挡力稍大；而座椅是左右侧的，稍微不方便，但换挡力小。

关于换档机构的防锈，尽量改善换档机构的位置，避免布置在车底。对于高低速、前驱等低档位操作，尽量用拉杆结构代替推拉索；对箱体上方这些部位的拨轴采取防锈、防浑水措施。

起重作业：在小块地的水田作业中，起重作业的使用频率也很高。一旦到达场地尽头进行掉头，必须将机器抬起；目前水田作业拖拉机的提升机主要有电控提升机、强压提升机、力位一体式提升机三种。稻田中比较受欢迎的是强力提压机；根据实际作业分析，主要原因是进入水田时，在水田较高的地方，需要使用提升机的强压功能，强压旋耕机挖土壤开辟一条平坦的道路，使拖拉机可以进入田间；又因水田草较多，不符合旋耕深度，需强压。

对于起升控制系统，机器起升时必须断开取力器轴，否则会损坏取力器轴。它需要在设计中加以考虑，这可以通过使用当前的Lexing804的结构并使用湿式PTO离合器来完成。安装传感器，一旦机具提升角度达到规定值，取力器轴自动断开，有效避免了故障的发生；此外，一旦起升系统起升启动且PTO离合器分离，则可以考虑将起升系统与辅助离合器操作机构相关联的关联机构。

辅助离合器控制：目前市场上的水田拖拉机通常采用独立控制的双作用离合器，辅助离合器由手柄操作。由于水田作业主要是通过带旋耕机或打浆机的取力器轴进行的，因此在田间转弯时需要经常操纵升降机将机器举起，取力器的动力传递起吊机器前必须断开离轴，否则动力输出轴会断裂，所以辅助离合器操作的使用频率也很高。如果操作力过大，操作者会感到疲劳，设计标准要求辅助离合器手柄的操作力不超过200N。